L'histoire se déroule après la grande bataile qui a opposée Ahténa et ses Chevaliers contre Hadès. Ce dernier est vaincu mais les conséquences sont terribles. Seiya est devenu un être enfermé dans son esprit que Athéna garde et protège chez elle tandis que le reste des autres chevaliers de bronze essayent de se soigner de leurs blessures. Soudain, la maison de campagne d'Athéna est attaqué. Seiya est sans défense est subit les foudres d'un guerrier puissant et masqué. Il s'agit de Toma d'Icarus. C'est un des chevalier d'Artémis la soeur d'Athéna. Cette dernière vient lui prévenir que les Dieux ont décidé de reprendre le contrôle de la Terre et ont attribué le Sanctuaire d'Athéna à Artémis. Quand à notre Saorie, elle doit faire face au jugement des Dieux. Nos Chevaliers vont devoir protèger leur Déesse une ultime fois avant de pourvoir trouver le repos qu'ils méritent. Seiya réveille toi de ton sommeil et délivre Athéna...